다음 세대의 염기서열 (ngs) 의정품의 폴리 아 폴리메라제

폴리 아 폴리메라제(PAP)는 RNA 분자의 3' 말단에 폴리-A 꼬리를 추가하는 데 책임이 있는 주요 효소 작용입니다. 이 활동은 RNA의 전반적인 안정성, 수송 및 번역에서 중요한 역할을 합니다. 그러나 NGS의 틀 내에서 PAP는 시퀀싱 전에 RNA 샘플에 A 올리고를 추가할 수 있게 하여 다양한 RNA 출처로부터 고품질 데이터를 획득할 수 있도록 합니다.

폴리 A 꼬리 추가의 중요성

mRNA에 폴리 A 꼬리를 통합하는 데는 많은 장점이 있습니다. 우선, A 꼬리는 엑소뉴클레아제에 의한 리보뉴클레아제 활동에 대한 RNA 분자의 안정성을 향상시키는 데 도움을 줍니다. 둘째, 폴리 A 꼬리는 리보솜이 mRNA에 부착되도록 촉진함으로써 번역 개시에서 역할을 합니다. NGS 준비의 경우, 폴리 A 꼬리가 있는 mRNA는 특정하게 농축될 수 있기 때문에 전사 변이와 함께 보다 집중적인 유전자 발현 분석에 쉽게 사용될 수 있습니다.

 NGS 샘플 준비

NGS 워크플로우에는 다음 단계가 포함된 RNA 샘플 준비가 포함됩니다: 역전사, cDNA 구성 및 증폭. 최종 cDNA 분자에 폴리-A 꼬리를 포함하기 위해 cDNA 합성 중에 폴리 A 중합효소를 추가하는 것이 일반적입니다. 이 수정은 라이브러리 증폭 및 시퀀싱에 중요하며, 라이브러리 준비에 관련된 단계의 효율성을 증가시킵니다.

RNA-Seq의 응용

PAP는 폴리 A 꼬리가 있는 mRNA에 대한 보다 효율적인 농축을 가능하게 하기 때문에 RNA 시퀀싱(RNA-Seq) 응용 프로그램에서도 매우 유용합니다. 이는 연구 중인 유기체의 보다 명확한 전사체 수준의 그림을 포착하는 데 도움이 됩니다. 따라서 이러한 향상은 차별적으로 발현된 유전자, 대체 스플라이싱 사건 또는 비코딩 RNA를 결정하는 데 도움이 될 수 있습니다. 또한 NGS 준비에 PAP를 포함하면 보다 유망한 데이터를 얻을 수 있습니다.

NGS 준비에 PAP를 추가하면 시퀀싱 데이터의 품질과 정확성을 크게 향상시킬 수 있습니다. 더 중요한 것은 연구가 계속 진행됨에 따라 과학자들이 전사체를 조사할 수 있도록 하는 PAP의 중요성이 여전히 크다는 것입니다.