次の世代の配列化 (ngs) 製剤におけるポリアポリマレス
ポリアポリメラーゼ(PAP)は、RNA分子の3'末端にポリAテールを追加する責任がある重要な酵素的作用です。この活動は、RNAの全体的な安定性、輸送、および翻訳において重要な役割を果たします。しかし、NGSの枠組みの中で、PAPはシーケンシング前にRNAサンプルにAオリゴを追加することを可能にし、さまざまなRNAソースから高品質のデータを取得できるようにします。
ポリAテーリングの重要性
mRNAにポリAテールを組み込むことには多くの利点があります。まず第一に、Aテールはエクソヌクレアーゼによるリボヌクレアーゼ活性に対するRNA分子の安定性を高めるのに役立ちます。第二に、ポリAテールはリボソームがmRNAに付着することを促進することによって翻訳開始に役割を果たします。NGS準備の場合、ポリAテール付きmRNAは特異的に濃縮できるため、転写変異とともにより焦点を絞った遺伝子発現分析に簡単に使用できます。
NGSサンプル準備
NGSワークフローには、以下のステップを含むRNAサンプルの準備が含まれます:逆転写、cDNA構築、および増幅。最終的なcDNA分子にポリAテールを含めるために、cDNA合成中にポリAポリメラーゼを追加することも一般的です。この修飾は、ライブラリの増幅とシーケンシングにとって重要であり、ライブラリの準備に関与するステップの効率を高めます。
RNA-Seqにおける応用
PAPはRNAシーケンシング(RNA-Seq)アプリケーションにおいて非常に便利であり、ポリAテールを持つmRNAのより効率的な濃縮を可能にします。これにより、研究対象の生物のトランスクリプトームレベルのより明確な画像をキャプチャするのに役立ちます。したがって、このような強化は、差次的に発現する遺伝子、選択的スプライシングイベント、または非コーディングRNAを特定するのに役立ちます。さらに、NGS準備にPAPを含めることで、より有望なデータを得ることができます。
NGS準備にPAPを追加することで、シーケンシングデータの質と精度が大幅に向上します。さらに重要なことに、研究が進むにつれて、科学者がトランスクリプトームを調査するためのPAPの重要性は依然として大きいでしょう。